Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms