Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms