Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP8A1Q9Y2Q0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms