Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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COPS3Q9UNS2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS3Q9UNS2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS3Q9UNS2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS3Q9UNS2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS3Q9UNS2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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