Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms