Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms