Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms