Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXF3Q9H4D5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXF3Q9H4D5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NXF3Q9H4D5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NXF3Q9H4D5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXF3Q9H4D5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms