Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2J2Q9GZM3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms