Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms