Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NIFKQ9BYG3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms