Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BBS2Q9BXC9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms