Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms