Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms