Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BICD1Q96G01 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BICD1Q96G01 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms