Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC97Q96F63 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms