Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 423.65■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 35.9
DGCR8Q8WYQ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 35.9
DGCR8Q8WYQ5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 35.9
DGCR8Q8WYQ5 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 411.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 35.9
DGCR8Q8WYQ5 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.43□□□□□ -1.543e-42■■■■■ 35.8
DGCR8Q8WYQ5 DLEU2-206ENST00000449579 791 ntTSL 28.38□□□□□ -1.075e-25■■■■■ 35.8
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 35.8
DGCR8Q8WYQ5 CTIF-204ENST00000587769 547 ntTSL 410.77□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 35.7
DGCR8Q8WYQ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.736e-11■■■■■ 35.6
DGCR8Q8WYQ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.516e-11■■■■■ 35.6
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-207ENST00000467407 739 ntTSL 314.5□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 35.6
DGCR8Q8WYQ5 YY1-205ENST00000554804 1114 ntTSL 36.75□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 35.5
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.684e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 NFAT5-207ENST00000565301 653 ntTSL 21.33□□□□□ -2.24e-7■■■■■ 35.4
DGCR8Q8WYQ5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 35.3
DGCR8Q8WYQ5 PISD-210ENST00000442379 722 ntTSL 213.08□□□□□ -0.321e-9■■■■■ 35.3
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-204ENST00000435365 1629 ntTSL 319.68■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 35.2
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 35.2
DGCR8Q8WYQ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 35.2
DGCR8Q8WYQ5 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.982e-7■■■■■ 35.1
DGCR8Q8WYQ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.373e-7■■■■■ 35.1
DGCR8Q8WYQ5 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)21.54■■□□□ 1.043e-7■■■■■ 35.1
DGCR8Q8WYQ5 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 320.16■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 35.1
DGCR8Q8WYQ5 PRKCE-203ENST00000421201 939 ntTSL 415.87■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 35.1
DGCR8Q8WYQ5 PRKCE-205ENST00000467135 1000 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 35.1
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-209ENST00000566674 969 ntTSL 513.9□□□□□ -0.187e-8■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.645e-10■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.55e-10■■■■■ 35
DGCR8Q8WYQ5 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 315.66■□□□□ 0.12e-10■■■■■ 34.8
DGCR8Q8WYQ5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 34.8
DGCR8Q8WYQ5 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 34.8
DGCR8Q8WYQ5 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.35□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 34.6
DGCR8Q8WYQ5 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 34.6
DGCR8Q8WYQ5 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 34.6
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-208ENST00000532581 2615 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 34.5
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 34.5
DGCR8Q8WYQ5 NAMPT-209ENST00000484527 833 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 34.5
DGCR8Q8WYQ5 TMEM164-208ENST00000497754 236 ntTSL 219.74■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 34.5
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-213ENST00000519113 859 ntTSL 318.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-211ENST00000518910 572 ntTSL 411.71□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-234ENST00000522227 642 ntTSL 38.37□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 48.06□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-215ENST00000519309 869 ntTSL 37.24□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CTNNA1-219ENST00000520158 719 ntTSL 35.63□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.998e-9■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CCDC57-201ENST00000327026 5379 ntTSL 216.26■□□□□ 0.198e-9■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-210ENST00000555652 379 ntTSL 321.94■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-212ENST00000555989 569 ntTSL 419.61■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-214ENST00000556780 591 ntTSL 519.29■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-204ENST00000553453 521 ntTSL 518.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-216ENST00000557151 744 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 N4BP2L2-212ENST00000505213 2343 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-213ENST00000556408 903 ntTSL 37.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-206ENST00000554362 552 ntTSL 53.85□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.992e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L1-205ENST00000554126 576 ntTSL 50.42□□□□□ -2.342e-7■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 AATK-205ENST00000572339 679 ntTSL 416.79■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 AATK-208ENST00000573469 754 ntTSL 515.52■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 34.4
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-263ENST00000495932 556 ntTSL 411.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-229ENST00000445625 759 ntTSL 511.07□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-255ENST00000487836 723 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-222ENST00000438278 871 ntTSL 510.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-259ENST00000492104 911 ntTSL 38.13□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-257ENST00000490562 593 ntTSL 42.86□□□□□ -1.953e-6■■■■■ 34.2
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 SNED1-207ENST00000431690 816 ntTSL 514.85□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 SNED1-203ENST00000401644 900 ntTSL 513.09□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -11e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 44.9□□□□□ -1.631e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 43.54□□□□□ -1.841e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 43.1□□□□□ -1.911e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 21.94□□□□□ -2.11e-10■■■■■ 34.1
DGCR8Q8WYQ5 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 518.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 34
DGCR8Q8WYQ5 MRPL33-203ENST00000448427 527 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 33.9
DGCR8Q8WYQ5 LINC00174-212ENST00000640964 4039 ntTSL 59.79□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 33.6
DGCR8Q8WYQ5 LINC00174-209ENST00000638517 4621 ntTSL 56.35□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 33.6
DGCR8Q8WYQ5 MEG3-210ENST00000452120 4489 ntTSL 212.57□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 33.5
DGCR8Q8WYQ5 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 222.03■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 33.5
DGCR8Q8WYQ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 33.5
DGCR8Q8WYQ5 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 220.13■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 33.5
DGCR8Q8WYQ5 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 33.5
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