Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP3Q8WYN3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP3Q8WYN3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms