Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX33Q8WV41 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms