Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APTXQ7Z2E3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms