Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms