Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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