Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KIAA0408Q6ZU52 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KIAA0408Q6ZU52 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms