Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms