Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNT1Q5JUK3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNT1Q5JUK3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms