Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAN3Q58A45 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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