Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms