Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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ECM1Q16610 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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ECM1Q16610 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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