Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RPE65Q16518 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RPE65Q16518 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RPE65Q16518 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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RPE65Q16518 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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RPE65Q16518 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPE65Q16518 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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