Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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