Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms