Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH1Q15438 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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