Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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