Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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