Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKP1Q13835 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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