Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOFQ13790 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOFQ13790 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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