Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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