Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTCH1Q13635 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms