Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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