Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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IFT88Q13099 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFT88Q13099 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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