Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DHX9Q08211 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms