Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNDQ07001 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms