Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK16Q00536 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms