Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM3BP58499 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms