Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP6P55212 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP6P55212 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP6P55212 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP6P55212 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP6P55212 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP6P55212 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms