Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MANFP55145 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MANFP55145 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MANFP55145 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms