Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THOP1P52888 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
THOP1P52888 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
THOP1P52888 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms