Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLCSP50747 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms