Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERFP50548 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERFP50548 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms