Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA4P48169 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms